A nedávna štúdia identifikuje the,en nový koronavírus zodpovedný za epidémiu pneumónie v čínskej provincii Hubei—Vírus netopiera je príbuzný s inými známymi patogénnymi koronavírusmi
2019 nový koronavírus (CoV) spôsobuje smrteľný zápal pľúc, ktorý si vyžiadal viac ako 1300 životov, s viac ako 52000 XNUMX potvrdenými prípadmi infekcie 13. február 2020, všetko v rozpätí niečo vyše mesiaca. Čo je to však tento vírus? Je to úplne nový vírus? Odkiaľ to prišlo? Vedci z popredných čínskych výskumných ústavov sa spojili, aby odpovedali na tieto otázky, a táto priekopnícka štúdia bola publikovaná v roku Čínsky lekársky vestník.
https://www.youtube.com/watch?v=jFKWluuMdgs
Začiatkom decembra začalo pár ľudí v meste Wuhan v čínskej provincii Hubei ochorieť po tom, čo sa vybrali na miestny trh s morskými plodmi. Vyskytli sa u nich príznaky ako kašeľ, horúčka a dýchavičnosť a dokonca komplikácie spojené so syndrómom akútnej respiračnej tiesne (ARDS). Okamžitou diagnózou bol zápal pľúc, presná príčina bola však neobjasnená. Čo spôsobilo toto nové ohnisko? Je to závažný akútny respiračný syndróm (SARS) -CoV? Je to blízkovýchodný respiračný syndróm (MERS) -CoV? Ako sa ukázalo, vedci v decembri po analýze prvých pár prípadov uskutočnili štúdiu zameranú na identifikáciu tohto vírusu. Táto štúdia je teraz publikovaná v Čínsky lekársky vestník a bola zistená identita vírusu - je to úplne nový vírus, ktorý úzko súvisí s CoV netopiera typu SARS. Dr. Jianwei Wang (Čínska akadémia lekárskych vied, Ústav biológie patogénov), vedúci výskumník štúdie, uvádza: „Náš príspevok preukázal identitu CoV netopierov pôvodu, ktorá bola doteraz neznáma."
V tejto štúdii vedci z renomovaných čínskych výskumných ústavov, ako sú Čínska akadémia lekárskych vied, Ústav patogénovej biológie, Nemocnica čínsko-japonského priateľstva a Lekárska vysoká škola Peking Union, spoločne objavili a identifikovali nový CoV - hlavného vinníka vypuknutie Wu-chanu - sekvenovaním novej generácie (NGS). Zamerali sa na päť pacientov prijatých do nemocnice Jin Yin-tan vo Wu-chane, z ktorých väčšina boli pracovníci trhu s morskými plodmi Huanan vo Wu-chane. Títo pacienti mali vysokú horúčku, kašeľ a ďalšie príznaky a pôvodne im bola diagnostikovaná pneumónia, ale s neznámou príčinou. Stav niektorých pacientov sa rýchlo zhoršil na ARDS; jeden dokonca zomrel. Dr. Wang hovorí: „Röntgenové snímky hrudníka pacientov vykazovali zakalené zákalu a spevnenie, ktoré sú typické pre zápal pľúc. Chceli sme však zistiť, čo spôsobilo zápal pľúc, a naše ďalšie experimenty odhalili presnú príčinu- nový CoV, ktorý nebol predtým známy."
Pre túto štúdiu vedci použili vzorky tekutín z bronchoalveolárneho výplachu (BAL) odobraté pacientom (BAL je postup, pri ktorom sa sterilná tekutina prenesie do pľúc bronchoskopom a potom sa odoberie na analýzu).
Najskôr sa vedci pokúsili identifikovať vírus pomocou sekvenovania genómu pomocou technológie NGS. NGS je preferovanou skríningovou metódou na identifikáciu neznámych patogénov, pretože rýchlo detekuje a vylučuje všetky známe patogénne mikroorganizmy vo vzorke. Na základe sekvenovania DNA / RNA zo vzoriek tekutín BAL vedci zistili, že väčšina načítaných vírusov patrí do rodiny CoV. Vedci potom zhromaždili rôzne „čítania“, ktoré patrili CoV, a skonštruovali celú genomickú sekvenciu pre nový vírus; tieto sekvencie boli na 99.8-99.9% podobné medzi vzorkami všetkých pacientov, čo potvrdzuje, že tento vírus bol bežným patogénom u všetkých pacientov. Ďalej pomocou analýzy homológie, kde sa porovnáva sekvencia genómu s inými známymi sekvenciami genómu (s prednastaveným prahom 90%, aby sa mohla považovať za „novú“ sekvenciu), potvrdili, že sekvencia genómu tohto nového vírusu je 79.0% podobný SARS-CoV, asi 51.8% podobný MERS-CoV a asi 87.6–87.7% podobný iným SARS-CoV od čínskych podkovárov (nazývaných ZC45 a ZXC21). Fylogenetická analýza ukázala, že sekvencie piatich získaných kmeňov CoV boli najbližšie k sekvenciám kmeňov odvodených od netopierov, ale tvorili samostatné evolučné vetvy. Tieto objavy jasne naznačujú, že vírus pochádzal z netopierov. Dr Wang tvrdí: „Pretože podobnosti vírusového replikázového génu so všetkými ostatnými známymi „podobnými“ vírusmi sú stále menej ako 90%, a tiež pri zohľadnení výsledkov fylogenetickej analýzy, považujeme to za skutočne novú, predtým neznámu CoV. Tento nový vírus sa dočasne nazýva 2019-ncov."
Nakoniec sa vedci presunuli k „izolácii“ vírusu zo vzoriek tekutín BAL kontrolou, či vzorky tekutín preukázali cytopatický účinok na bunkové línie v laboratóriu. Bunky vystavené vzorkám tekutín boli pozorované pod elektrónovým mikroskopom a vedci našli charakteristické štruktúry podobné CoV. Použili tiež imunofluorescenciu - techniku, ktorá využíva špecifické protilátky označené fluorescenčnými farbivami. Na tento účel použili sérum od zotavujúcich sa pacientov (ktoré obsahovalo protilátky), ktoré reagovalo s vírusovými časticami vo vnútri buniek; to potvrdilo, že tento vírus bol skutočne pôvodcom infekcie.
Táto štúdia pripravuje pôdu pre budúce štúdie na lepšie pochopenie vírusu a jeho zdrojov, najmä vzhľadom na jeho rýchle šírenie, schopnosť spôsobiť smrteľné ARDS a paniku spôsobenú ohniskom nákazy. Aj keď 4 z 5 pacientov, od ktorých bol tento vírus identifikovaný, pochádzali z trhu s morskými plodmi vo Wu-chane, presný pôvod infekcie nie je známy. CoV sa mohla prenášať na človeka prostredníctvom „medziľahlého“ nosiča, ako napríklad v prípade SARS-CoV (cibetkové mäso z palmy) alebo MERS-CoV (ťava). Dr. Wang uzatvára: „Všetky ľudské CoV sú zoonotické a niekoľko ľudských CoV pochádza z netopierov, vrátane SARS- a MERS-CoV. Naša štúdia jasne ukazuje naliehavú potrebu pravidelného monitorovania prenosu CoV netopierov na človeka. Výskyt tohto vírusu predstavuje obrovskú hrozbu pre verejné zdravie, a preto je mimoriadne dôležité porozumieť zdroju tohto vírusu a rozhodnúť o ďalších krokoch skôr, ako sa staneme svedkami ohniska vo väčšom rozsahu.. "
